13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0896 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0896  hypothetical protein  100 
 
 		 92 aa  192  1e-48  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000152682  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0199  hypothetical protein  69.57 
 
 		 94 aa  135  2e-31  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.483017 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1399  addiction module antitoxin  53.76 
 
 		 96 aa  100  8e-21  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.962598 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0528  hypothetical protein  49.46 
 
 		 96 aa  95.9  2e-19  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1577  hypothetical protein  53.93 
 
 		 92 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000000158487  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1113  hypothetical protein  48.39 
 
 		 97 aa  90.5  7e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.596296 
 
 
-
 
NC_008760  Pnap_4619  hypothetical protein  52.94 
 
 		 97 aa  89  2e-17  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2630  hypothetical protein  47.31 
 
 		 96 aa  86.3  1e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0398  hypothetical protein  43.62 
 
 		 95 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0280  hypothetical protein  53.49 
 
 		 92 aa  74.7  0.0000000000004  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.863592  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02182  hypothetical protein  53.73 
 
 		 69 aa  70.1  0.00000000001  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.636046  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0286  hypothetical protein  37.5 
 
 		 96 aa  50.1  0.00001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00972364  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4056  plasmid stabilization system  32.84 
 
 		 98 aa  41.2  0.005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>