9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_3382 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_3382  hypothetical protein  100 
 
 		 202 aa  420  1e-117  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.565098  normal  0.979482 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3421  hypothetical protein  79.21 
 
 		 202 aa  346  1e-94  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  unclonable  9.28067e-17 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2796  hypothetical protein  73.91 
 
 		 207 aa  323  7e-88  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.229034  normal  0.311657 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0798  hypothetical protein  64.56 
 
 		 206 aa  286  1e-76  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00459304 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3234  hypothetical protein  62.19 
 
 		 210 aa  261  6e-69  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00173261 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2435  hypothetical protein  47.52 
 
 		 213 aa  206  2e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.589262  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5698  hypothetical protein  46.83 
 
 		 209 aa  181  8.000000000000001e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0999  transposase  45.16 
 
 		 192 aa  162  4.0000000000000004e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00221733 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1663  hypothetical protein  36.67 
 
 		 147 aa  65.1  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.0000338743  normal  0.310155 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>