20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pput_0106 on replicon NC_009512
Organism: Pseudomonas putida F1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  100 
 
 		 137 aa  283  5e-76  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  97.81 
 
 		 137 aa  279  7.000000000000001e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  97.81 
 
 		 137 aa  277  3e-74  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  91.97 
 
 		 137 aa  266  8.999999999999999e-71  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  54.03 
 
 		 139 aa  143  8.000000000000001e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  52.9 
 
 		 162 aa  135  2e-31  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  51.49 
 
 		 144 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  47.14 
 
 		 140 aa  122  1e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  53.98 
 
 		 139 aa  120  5e-27  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  50.85 
 
 		 145 aa  107  4.0000000000000004e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  50 
 
 		 145 aa  107  7.000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  43.12 
 
 		 138 aa  97.1  8e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  38.76 
 
 		 140 aa  90.5  6e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  37.5 
 
 		 137 aa  85.9  2e-16  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  38.28 
 
 		 137 aa  85.1  3e-16  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  36.72 
 
 		 137 aa  84.7  4e-16  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  38.79 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  38.4 
 
 		 137 aa  83.6  7e-16  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  38.1 
 
 		 138 aa  77.8  0.00000000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  38.1 
 
 		 138 aa  77.4  0.00000000000006  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>