20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0150 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



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Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0150  lipoprotein, putative  100 
 
 		 144 aa  303  4.0000000000000004e-82  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0042  putative lipoprotein  88.65 
 
 		 162 aa  251  2.0000000000000002e-66  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0106  hypothetical protein  52.24 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0091  putative lipoprotein  51.49 
 
 		 137 aa  137  6e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00428998 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0106  lipoprotein  51.49 
 
 		 137 aa  134  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000139404 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0095  putative lipoprotein  51.97 
 
 		 139 aa  133  6.0000000000000005e-31  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0109  lipoprotein  50.75 
 
 		 137 aa  133  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.655067  hitchhiker  0.00731713 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4454  hypothetical protein  52.17 
 
 		 139 aa  125  2.0000000000000002e-28  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2584  lipoprotein  43.18 
 
 		 140 aa  114  3.9999999999999997e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.968594 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00730  hypothetical protein  48.48 
 
 		 145 aa  111  3e-24  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0061  putative lipoprotein  47.37 
 
 		 145 aa  109  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.704152  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01170  hypothetical protein  43.26 
 
 		 138 aa  105  3e-22  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.791841  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0094  putative lipoprotein  39.55 
 
 		 140 aa  94.4  5e-19  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_01160  hypothetical protein  37.7 
 
 		 139 aa  86.3  1e-16  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0107  lipoprotein  34.65 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000001  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000352453 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0107  hypothetical protein  34.65 
 
 		 137 aa  82.8  0.000000000000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0110  lipoprotein  33.86 
 
 		 137 aa  82.4  0.000000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.604629  normal  0.0221205 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0092  putative lipoprotein  33.86 
 
 		 137 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00441093 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0062  putative lipoprotein  33.9 
 
 		 138 aa  72  0.000000000003  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.731154  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00740  putative lipoprotein  33.91 
 
 		 138 aa  71.6  0.000000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.369116  normal  1 
 
 
-
 
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