12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputW619_0693 on replicon NC_010501
Organism: Pseudomonas putida W619



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010501  PputW619_0693  hypothetical protein  100 
 
 
89 aa  185  2e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000000477278 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0691  hypothetical protein  98.88 
 
 
89 aa  182  9e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000978963 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0223  hypothetical protein  67.47 
 
 
89 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.841238 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4933  hypothetical protein  60.47 
 
 
93 aa  112  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.000000154034  hitchhiker  0.0000000705895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4876  hypothetical protein  60.76 
 
 
82 aa  103  1e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.770869  normal  0.193901 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2026  hypothetical protein  46.84 
 
 
88 aa  77  0.00000000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.762179  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4369  hypothetical protein  41.25 
 
 
84 aa  50.1  0.00001  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4388  hypothetical protein  37.66 
 
 
129 aa  48.1  0.00004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.100339 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0090  hypothetical protein  31.31 
 
 
100 aa  43.9  0.0008  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.218001  hitchhiker  0.0000147409 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0087  hypothetical protein  32.61 
 
 
105 aa  43.5  0.0009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.585828 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0071  hypothetical protein  32.61 
 
 
153 aa  43.1  0.001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.664883  hitchhiker  0.0000574078 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5302  hypothetical protein  30.43 
 
 
97 aa  42  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.610858 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>