11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_5326 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_5326  hypothetical protein  100 
 
 		 76 aa  153  9e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0404584 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5274  hypothetical protein  96.05 
 
 		 107 aa  149  2e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.400287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5184  hypothetical protein  94.74 
 
 		 76 aa  145  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0281907 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0196  hypothetical protein  88.16 
 
 		 76 aa  139  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.360735  hitchhiker  0.00059571 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5530  hypothetical protein  53.75 
 
 		 81 aa  80.1  0.00000000000001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.391178 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0231  hypothetical protein  48.78 
 
 		 83 aa  75.5  0.0000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0097  hypothetical protein  46.34 
 
 		 101 aa  68.9  0.00000000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3736  hypothetical protein  48.98 
 
 		 67 aa  45.4  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.149261  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1441  hypothetical protein  55 
 
 		 62 aa  42.7  0.002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_38260  hypothetical protein  49.09 
 
 		 84 aa  41.6  0.004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.0117303 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2778  hypothetical protein  55.88 
 
 		 72 aa  41.2  0.005  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.244117  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>