10 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PputGB1_0525 on replicon NC_010322
Organism: Pseudomonas putida GB-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010322  PputGB1_0525  hypothetical protein  100 
 
 		 448 aa  921    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  unclonable  0.000000000000539959  normal  0.748785 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3919  hypothetical protein  48.97 
 
 		 447 aa  436  1e-121  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.713535  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2161  hypothetical protein  35.92 
 
 		 457 aa  208  2e-52  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.138139  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4034  hypothetical protein  32.3 
 
 		 466 aa  197  4.0000000000000005e-49  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.332359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7050  hypothetical protein  32.46 
 
 		 453 aa  187  3e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4983  hypothetical protein  29.57 
 
 		 475 aa  179  1e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2512  hypothetical protein  33.33 
 
 		 317 aa  125  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0527  hypothetical protein  24.93 
 
 		 573 aa  101  3e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000194585  normal  0.666822 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0143  hypothetical protein  28.19 
 
 		 344 aa  49.3  0.0001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.00278866  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2513  hypothetical protein  29.75 
 
 		 137 aa  46.6  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>