11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ppha_0839 on replicon NC_011060
Organism: Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011060  Ppha_0839  Abortive infection protein  100 
 
 		 225 aa  449  1e-125  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1934  abortive infection protein  64.73 
 
 		 228 aa  291  8e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0479638  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0682  Abortive infection protein  62.05 
 
 		 229 aa  287  9e-77  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.553094 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1314  hypothetical protein  61.95 
 
 		 229 aa  279  2e-74  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0785  Abortive infection protein  60.71 
 
 		 229 aa  278  4e-74  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00758504  normal  0.222766 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0500  Abortive infection protein  63.39 
 
 		 268 aa  266  2.9999999999999995e-70  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0162242  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0544  hypothetical protein  60 
 
 		 213 aa  248  8e-65  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.2221  normal  0.584654 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0951  abortive infection protein  47.32 
 
 		 231 aa  204  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3590  abortive infection protein  47.32 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.72042  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3804  Abortive infection protein  44.59 
 
 		 230 aa  181  1e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.000114465  normal  0.352645 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1730  Abortive infection protein  28.05 
 
 		 237 aa  42.7  0.004  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>