35 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_0958 on replicon NC_008781
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008781  Pnap_0958  hypothetical protein  100 
 
 
72 aa  152  1e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0907  hypothetical protein  72.22 
 
 
72 aa  113  8.999999999999998e-25  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4090  hypothetical protein  66.15 
 
 
68 aa  93.6  8e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.879783  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_3838  hypothetical protein  54.55 
 
 
67 aa  77.4  0.00000000000006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.120918  normal  0.818547 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1078  hypothetical protein  55.88 
 
 
68 aa  77.4  0.00000000000007  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2814  hypothetical protein  50.77 
 
 
67 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.114684  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3491  hypothetical protein  50.77 
 
 
67 aa  73.6  0.0000000000009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.338581  normal  0.775652 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1839  hypothetical protein  50 
 
 
67 aa  69.3  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.1286  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2445  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.174632  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2440  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1829  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.897002  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3029  hypothetical protein  47.69 
 
 
68 aa  63.2  0.000000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.770306  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2487  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.84256  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5771  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0677074  normal  0.233102 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2355  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.251994  normal  0.280946 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0854  hypothetical protein  50 
 
 
69 aa  61.6  0.000000004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2598  hypothetical protein  51.79 
 
 
62 aa  60.8  0.000000006  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.577812 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0670  hypothetical protein  51.79 
 
 
89 aa  60.8  0.000000007  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2761  hypothetical protein  43.08 
 
 
66 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.224199 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2195  hypothetical protein  53.57 
 
 
61 aa  58.9  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0828402  normal  0.627418 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0646  hypothetical protein  53.57 
 
 
62 aa  59.3  0.00000002  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2977  hypothetical protein  51.79 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0748374  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1622  hypothetical protein  51.79 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  hitchhiker  0.0045965  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1052  hypothetical protein  51.79 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1045  hypothetical protein  51.79 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.340225  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2309  hypothetical protein  51.79 
 
 
62 aa  58.2  0.00000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.027643  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1158  hypothetical protein  43.94 
 
 
66 aa  57  0.00000009  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.804902  normal  0.914913 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0850  hypothetical protein  48.21 
 
 
62 aa  56.6  0.0000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.484258  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1210  hypothetical protein  50 
 
 
62 aa  55.8  0.0000002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  hitchhiker  0.000107283  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1012  hypothetical protein  48.21 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3486  hypothetical protein  48.21 
 
 
61 aa  55.8  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.551768  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2385  hypothetical protein  46.43 
 
 
62 aa  55.5  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00411615 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0099  hypothetical protein  43.64 
 
 
62 aa  50.8  0.000005  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.16948  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2194  hypothetical protein  51.79 
 
 
62 aa  50.8  0.000007  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.136519 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_4016  hypothetical protein  36.36 
 
 
62 aa  41.6  0.004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>