15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_2128 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009439  Pmen_2128  hypothetical protein  100 
 
 		 68 aa  135  1e-31  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0722905  normal  0.190811 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_28470  hypothetical protein  55.36 
 
 		 65 aa  64.7  0.0000000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000281065 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2484  hypothetical protein  55.36 
 
 		 65 aa  64.3  0.0000000005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3518  hypothetical protein  47.27 
 
 		 64 aa  61.2  0.000000005  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.65848  normal  0.064061 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2222  hypothetical protein  48.08 
 
 		 65 aa  60.5  0.000000008  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1845  hypothetical protein  48.08 
 
 		 64 aa  60.5  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0535712  normal  0.0788122 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2416  hypothetical protein  54.17 
 
 		 60 aa  55.5  0.0000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0904572  normal  0.707769 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3325  hypothetical protein  43.86 
 
 		 67 aa  56.2  0.0000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3451  hypothetical protein  43.4 
 
 		 64 aa  55.8  0.0000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.406461 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2683  hypothetical protein  57.14 
 
 		 60 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.446772  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3716  hypothetical protein  52.08 
 
 		 60 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.212532  normal  0.868139 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2098  hypothetical protein  42.65 
 
 		 60 aa  50.8  0.000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.727852  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3770  hypothetical protein  47.92 
 
 		 60 aa  49.7  0.00001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  hitchhiker  0.0000131048  hitchhiker  0.00000677863 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1993  hypothetical protein  45.83 
 
 		 60 aa  46.6  0.0001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000348245  decreased coverage  0.00000853865 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2133  hypothetical protein  43.75 
 
 		 60 aa  45.1  0.0003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000121334  hitchhiker  0.000000470737 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>