13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pmen_0981 on replicon NC_009439
Organism: Pseudomonas mendocina ymp



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_002947  PP_0695  hypothetical protein  84.35 
 
 		 444 aa  701    Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0990  hypothetical protein  86.06 
 
 		 425 aa  715    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0855  hypothetical protein  86.31 
 
 		 425 aa  717    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.333592 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4777  hypothetical protein  84.63 
 
 		 448 aa  694    Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61960  hypothetical protein  85.78 
 
 		 432 aa  700    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194335  normal  0.201094 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0981  hypothetical protein  100 
 
 		 413 aa  828    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000413091 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0727  hypothetical protein  84.35 
 
 		 444 aa  701    Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.227514  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5391  hypothetical protein  85.78 
 
 		 432 aa  698    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0727  hypothetical protein  84.35 
 
 		 429 aa  701    Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4490  hypothetical protein  84.6 
 
 		 425 aa  701    Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.590071 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1263  hypothetical protein  25.94 
 
 		 425 aa  124  3e-27  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008758  Pnap_4441  hypothetical protein  26.22 
 
 		 435 aa  116  7.999999999999999e-25  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0268222  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3602  hypothetical protein  26.77 
 
 		 419 aa  110  5e-23  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>