13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pnap_4441 on replicon NC_008758
Organism: Polaromonas naphthalenivorans CJ2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008758  Pnap_4441  hypothetical protein  100 
 
 
435 aa  872    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.0268222  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3602  hypothetical protein  55.4 
 
 
419 aa  435  1e-121  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1263  hypothetical protein  45.76 
 
 
425 aa  375  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0695  hypothetical protein  26.38 
 
 
444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0727  hypothetical protein  26.38 
 
 
444 aa  130  5.0000000000000004e-29  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.227514  normal  0.143826 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0727  hypothetical protein  26.87 
 
 
429 aa  129  1.0000000000000001e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_61960  hypothetical protein  28.19 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.194335  normal  0.201094 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5391  hypothetical protein  28.19 
 
 
432 aa  127  4.0000000000000003e-28  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4490  hypothetical protein  27.1 
 
 
425 aa  125  2e-27  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.913394  normal  0.590071 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4777  hypothetical protein  26.29 
 
 
448 aa  120  6e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.126132 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0981  hypothetical protein  25.96 
 
 
413 aa  115  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000413091 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0990  hypothetical protein  26.68 
 
 
425 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.138531  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0855  hypothetical protein  26.49 
 
 
425 aa  114  3e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.333592 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>