21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plim_3935 on replicon NC_014148
Organism: Planctomyces limnophilus DSM 3776



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014148  Plim_3935  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  100 
 
 
116 aa  234  2e-61  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6286  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  40.87 
 
 
119 aa  93.2  1e-18  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.0000000275073  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2923  metal dependent phosphohydrolase  43.52 
 
 
251 aa  75.5  0.0000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.849083 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1551  hypothetical protein  41.28 
 
 
104 aa  70.1  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5644  hypothetical protein  33.93 
 
 
301 aa  63.5  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.469947  normal  0.854948 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6154  hypothetical protein  37.04 
 
 
106 aa  62.8  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.574022  hitchhiker  0.000554125 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1509  hypothetical protein  33.02 
 
 
99 aa  49.7  0.00001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0150979  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2905  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.48 
 
 
129 aa  48.9  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1109  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.75 
 
 
132 aa  46.6  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0520  lactoylglutathione lyase  32.52 
 
 
135 aa  44.3  0.0005  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.0107856 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5734  hypothetical protein  30.43 
 
 
120 aa  43.1  0.001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0632882  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2702  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.78 
 
 
140 aa  42.4  0.002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.419453 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3246  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.51 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0396  lactoylglutathione lyase  30.33 
 
 
135 aa  42.4  0.002  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.789224  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1860  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.74 
 
 
114 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0411  lactoylglutathione lyase  32.52 
 
 
135 aa  41.6  0.003  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.208299  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0308  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.81 
 
 
167 aa  42  0.003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0496645  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_17360  Glyoxalase/Bleomycin resistance protein/Dioxygenase superfamily  28.91 
 
 
130 aa  41.6  0.004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.1734  normal  0.0877345 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3703  lactoylglutathione lyase  31.15 
 
 
146 aa  40.8  0.007  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4132  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.73 
 
 
132 aa  40.8  0.007  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.033179  hitchhiker  0.0000263057 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3513  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  30.95 
 
 
174 aa  40.4  0.007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.0738114 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>