12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_3515 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_1220  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3515  hypothetical protein  100 
 
 		 88 aa  181  4.0000000000000006e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.341735  normal  0.667313 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3028  hypothetical protein  86.36 
 
 		 87 aa  152  1e-36  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.300411  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3063  hypothetical protein  83.91 
 
 		 87 aa  147  6e-35  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.542031  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3821  hypothetical protein  80.49 
 
 		 83 aa  136  1e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.688246  n/a   
 
 
-
 
NC_011370  Rleg2_6190  hypothetical protein  77.22 
 
 		 84 aa  134  5e-31  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00455436 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3153  hypothetical protein  70.45 
 
 		 88 aa  130  5e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.328653  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7411  hypothetical protein  80 
 
 		 80 aa  122  2e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.572065  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2127  hypothetical protein  78.57 
 
 		 80 aa  118  1.9999999999999998e-26  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7716  hypothetical protein  76.39 
 
 		 82 aa  113  6.9999999999999995e-25  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.108043 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2654  hypothetical protein  62.86 
 
 		 71 aa  104  4e-22  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.192048 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3088  hypothetical protein  74.58 
 
 		 116 aa  99  2e-20  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.60135  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>