18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Plav_2190 on replicon NC_009719
Organism: Parvibaculum lavamentivorans DS-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009719  Plav_2190  hypothetical protein  100 
 
 		 205 aa  414  9.999999999999999e-116  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0589  hypothetical protein  65.99 
 
 		 206 aa  270  9e-72  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0852  hypothetical protein  63.21 
 
 		 202 aa  249  2e-65  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0917  hypothetical protein  63.21 
 
 		 202 aa  248  6e-65  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165601  normal  0.0427176 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3018  hypothetical protein  55.33 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2251  hypothetical protein  55.33 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1367  hypothetical protein  55.33 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3147  hypothetical protein  55.33 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1276  hypothetical protein  55.33 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0989  hypothetical protein  55.33 
 
 		 202 aa  222  3e-57  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0232641  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6463  hypothetical protein  53 
 
 		 203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6055  hypothetical protein  53 
 
 		 203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6381  hypothetical protein  53.5 
 
 		 203 aa  215  2.9999999999999998e-55  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263052  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1366  hypothetical protein  53 
 
 		 203 aa  216  2.9999999999999998e-55  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315159  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_5633  hypothetical protein  53 
 
 		 203 aa  214  9e-55  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00862014  normal  0.0392655 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5459  hypothetical protein  57.14 
 
 		 202 aa  213  9.999999999999999e-55  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527881  hitchhiker  0.00230967 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2255  hypothetical protein  28.22 
 
 		 239 aa  57  0.0000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0349921  normal  0.149451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2415  hypothetical protein  27.43 
 
 		 269 aa  45.4  0.0006  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>