19 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bamb_5633 on replicon NC_008392
Organism: Burkholderia ambifaria AMMD



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008392  Bamb_5633  hypothetical protein  100 
 
 		 203 aa  413  1e-114  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  hitchhiker  0.00862014  normal  0.0392655 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6381  hypothetical protein  99.51 
 
 		 203 aa  412  1e-114  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.263052  normal  0.2899 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1366  hypothetical protein  95.57 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.315159  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6463  hypothetical protein  95.57 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6055  hypothetical protein  95.57 
 
 		 203 aa  397  9.999999999999999e-111  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.971023  normal  0.120372 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5459  hypothetical protein  88.67 
 
 		 202 aa  343  8e-94  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.527881  hitchhiker  0.00230967 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3018  hypothetical protein  66.83 
 
 		 202 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.166799  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2251  hypothetical protein  66.83 
 
 		 202 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1367  hypothetical protein  66.83 
 
 		 202 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.99909  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3147  hypothetical protein  66.83 
 
 		 202 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.7584  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1276  hypothetical protein  66.83 
 
 		 202 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0989  hypothetical protein  66.83 
 
 		 202 aa  272  2.0000000000000002e-72  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0232641  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0852  hypothetical protein  58.12 
 
 		 202 aa  225  4e-58  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0917  hypothetical protein  57.59 
 
 		 202 aa  220  9e-57  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.165601  normal  0.0427176 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0589  hypothetical protein  56.02 
 
 		 206 aa  215  4e-55  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2190  hypothetical protein  53 
 
 		 205 aa  214  9e-55  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3370  hypothetical protein  27.33 
 
 		 260 aa  49.7  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2255  hypothetical protein  24.07 
 
 		 239 aa  48.5  0.00006  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0349921  normal  0.149451 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2415  hypothetical protein  24.81 
 
 		 269 aa  46.2  0.0003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.347106  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>