14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Phep_2413 on replicon NC_013061
Organism: Pedobacter heparinus DSM 2366



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013061  Phep_2413  DinB family protein  100 
 
 
158 aa  330  5e-90  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.181086  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1770  hypothetical protein  35.4 
 
 
162 aa  101  5e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00553228  normal  0.588204 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3191  DinB family protein  35.4 
 
 
162 aa  100  8e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.268662  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3491  hypothetical protein  34.16 
 
 
164 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000421568  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3478  hypothetical protein  34.78 
 
 
162 aa  99.4  2e-20  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.609177  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3508  hypothetical protein  34.57 
 
 
163 aa  98.6  3e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.559938  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3496  DinB family  33.54 
 
 
162 aa  95.1  3e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3195  hypothetical protein  33.54 
 
 
162 aa  94  8e-19  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3282  hypothetical protein  32.72 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0481005  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3252  hypothetical protein  32.72 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0302747  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3539  hypothetical protein  32.72 
 
 
163 aa  93.2  1e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.509353  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0954  DinB family protein  28.75 
 
 
163 aa  75.1  0.0000000000004  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.126784 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0076  DinB  51.43 
 
 
185 aa  41.6  0.004  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2474  DinB family protein  22.63 
 
 
173 aa  41.6  0.004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.193156 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>