27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pecwa_2382 on replicon NC_013421
Organism: Pectobacterium wasabiae WPP163



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_2871  hypothetical protein  43.38 
 
 		 1044 aa  843    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.33862  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2382  virulence protein SrfB  100 
 
 		 995 aa  2056    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0470  virulence protein SrfB  52.88 
 
 		 1000 aa  1081    Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2094  virulence protein SrfB  97.39 
 
 		 995 aa  1981    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.125719  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2101  virulence protein SrfB  77.81 
 
 		 996 aa  1592    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.485663  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1881  virulence protein SrfB  78.19 
 
 		 995 aa  1600    Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.0611287  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_52090  hypothetical protein  53.44 
 
 		 992 aa  1078    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.18619  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1747  virulence protein SrfB  57.16 
 
 		 993 aa  1184    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.841748  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1566  virulence protein SrfB  57.16 
 
 		 993 aa  1184    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.823683  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1712  virulence protein SrfB  57.06 
 
 		 993 aa  1184    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.715091 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1774  virulence protein SrfB  57.16 
 
 		 993 aa  1184    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.513722  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1709  virulence protein SrfB  57.16 
 
 		 993 aa  1185    Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2281  SrfB superfamily virulence factor  71.4 
 
 		 987 aa  1469    Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1434  virulence protein SrfB  64.92 
 
 		 981 aa  1336    Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1843  putative virulence factor SrfB  74.1 
 
 		 1023 aa  1527    Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2109  virulence protein SrfB  57.83 
 
 		 993 aa  1204    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.936514 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4239  virulence protein SrfB  52.44 
 
 		 1000 aa  1062    Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.104797  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2632  virulence protein SrfB  42.91 
 
 		 1044 aa  833    Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.623195  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1845  hypothetical protein  44.93 
 
 		 996 aa  874    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.90632  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1953  putative virulence factor SrfB  75.07 
 
 		 383 aa  551  1e-155  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3154  hypothetical protein  34.21 
 
 		 993 aa  551  1e-155  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.30642  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1313  virulence factor SrfB-like protein  33.87 
 
 		 1036 aa  509  1e-143  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0897  virulence protein SrfB  32.86 
 
 		 1041 aa  495  9.999999999999999e-139  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.112933  normal  0.362744 
 
 
-
 
NC_009430  Rsph17025_4052  hypothetical protein  33.02 
 
 		 1020 aa  488  1e-136  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0348037  normal  0.215609 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1964  virulence protein SrfB  31.78 
 
 		 1042 aa  450  1e-125  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.406183  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3216  virulence factor SrfB-like protein  31.72 
 
 		 996 aa  397  1e-109  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.952482 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6482  virulence protein SrfB  29.22 
 
 		 1048 aa  340  8e-92  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>