17 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4922 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4922  hypothetical protein  100 
 
 		 367 aa  741    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.987878  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_3079  hypothetical protein  38.86 
 
 		 369 aa  226  5.0000000000000005e-58  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  hitchhiker  0.0000715673  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0022  hypothetical protein  38.58 
 
 		 369 aa  218  1e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.205908  normal  0.027287 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1499  hypothetical protein  33.04 
 
 		 377 aa  218  2e-55  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000788188 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0416  hypothetical protein  33.04 
 
 		 376 aa  214  1.9999999999999998e-54  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0594  hypothetical protein  37.39 
 
 		 378 aa  214  1.9999999999999998e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.0000000709427  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2496  hypothetical protein  36.78 
 
 		 371 aa  177  3e-43  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0619786  normal  0.163334 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0085  cyanophycin synthetase  26.51 
 
 		 885 aa  45.4  0.002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3707  pyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 1148 aa  44.3  0.003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.863258  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4065  pyruvate carboxylase  32.18 
 
 		 1148 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0164116  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1190  pyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 1148 aa  44.7  0.003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4157  pyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 1148 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.820084  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3690  pyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 1148 aa  44.3  0.004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3859  pyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 1148 aa  44.3  0.004  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3962  pyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 1148 aa  44.3  0.004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3994  pyruvate carboxylase  33.33 
 
 		 1148 aa  43.9  0.004  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.882525  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4050  pyruvate carboxylase  32.14 
 
 		 1148 aa  42.7  0.01  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.898796  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>