30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4689 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4689  hypothetical protein  100 
 
 		 151 aa  308  1e-83  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.174344 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1279  hypothetical protein  60.34 
 
 		 120 aa  155  1e-37  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0012  hypothetical protein  65.14 
 
 		 116 aa  154  4e-37  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2008  putative cytoplasmic protein  60.68 
 
 		 120 aa  153  1e-36  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1231  putative cytoplasmic protein  59.5 
 
 		 124 aa  150  8e-36  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2677  uncharacterized protein YneG  56.03 
 
 		 121 aa  146  9e-35  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.861619  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2123  conserved hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0481782  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01480  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1683  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.269502  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01491  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1649  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1723  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  145  1.0000000000000001e-34  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195802  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1639  putative cytoplasmic protein  59.83 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1698  hypothetical protein  59.83 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0302955  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1644  putative cytoplasmic protein  59.83 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000948232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1809  hypothetical protein  59.83 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.123298  normal  1 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2136  hypothetical protein  58.82 
 
 		 119 aa  145  2.0000000000000003e-34  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.491801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1631  putative cytoplasmic protein  58.97 
 
 		 119 aa  144  6e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.403763  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2135  hypothetical protein  57.98 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1605  hypothetical protein  57.98 
 
 		 119 aa  142  1e-33  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.301382  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0620  hypothetical protein  59.46 
 
 		 136 aa  138  3e-32  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.0979485 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5901  hypothetical protein  62.5 
 
 		 119 aa  134  3.0000000000000003e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00715743 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1706  hypothetical protein  56.03 
 
 		 125 aa  135  3.0000000000000003e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0146  hypothetical protein  55.45 
 
 		 136 aa  132  9.999999999999999e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4771  hypothetical protein  59.82 
 
 		 140 aa  131  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0077  hypothetical protein  58.93 
 
 		 148 aa  129  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616171  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1478  hypothetical protein  45.05 
 
 		 121 aa  125  3e-28  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1022  hypothetical protein  48.21 
 
 		 119 aa  116  9.999999999999999e-26  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0442  putative cytoplasmic protein  48.78 
 
 		 102 aa  103  1e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4277  putative cytoplasmic protein  44.63 
 
 		 147 aa  101  4e-21  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>