30 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_2677 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_2677  uncharacterized protein YneG  100 
 
 
121 aa  255  2e-67  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.861619  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1231  putative cytoplasmic protein  78.81 
 
 
124 aa  202  9e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1279  hypothetical protein  72.5 
 
 
120 aa  195  2.0000000000000003e-49  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.522508  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01491  hypothetical protein  70.54 
 
 
119 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01480  hypothetical protein  70.54 
 
 
119 aa  179  1e-44  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1683  hypothetical protein  70.54 
 
 
119 aa  179  1e-44  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.269502  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1649  hypothetical protein  70.54 
 
 
119 aa  179  1e-44  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1723  hypothetical protein  70.54 
 
 
119 aa  179  1e-44  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.195802  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2123  conserved hypothetical protein  70.54 
 
 
119 aa  179  1e-44  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0481782  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2136  hypothetical protein  69.64 
 
 
119 aa  177  4.999999999999999e-44  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.491801  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2008  putative cytoplasmic protein  71.43 
 
 
120 aa  176  7e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.0760029 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1639  putative cytoplasmic protein  71.43 
 
 
119 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1644  putative cytoplasmic protein  71.43 
 
 
119 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000948232  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1809  hypothetical protein  71.43 
 
 
119 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.123298  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1605  hypothetical protein  68.75 
 
 
119 aa  174  3e-43  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.301382  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2135  hypothetical protein  68.75 
 
 
119 aa  174  3e-43  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1631  putative cytoplasmic protein  70.54 
 
 
119 aa  174  4e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.403763  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1698  hypothetical protein  70.54 
 
 
119 aa  173  5e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.0302955  normal 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0012  hypothetical protein  58.77 
 
 
116 aa  149  2e-35  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008688  Pden_4689  hypothetical protein  56.03 
 
 
151 aa  146  9e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.174344 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0620  hypothetical protein  57.52 
 
 
136 aa  144  4.0000000000000006e-34  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.376384  normal  0.0979485 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1706  hypothetical protein  58.97 
 
 
125 aa  140  4e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_0077  hypothetical protein  57.14 
 
 
148 aa  136  1e-31  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616171  normal  0.536449 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0146  hypothetical protein  51.3 
 
 
136 aa  134  4e-31  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4771  hypothetical protein  60.71 
 
 
140 aa  129  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_5901  hypothetical protein  57.14 
 
 
119 aa  127  6e-29  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00715743 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1478  hypothetical protein  46.43 
 
 
121 aa  127  6e-29  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1022  hypothetical protein  52.68 
 
 
119 aa  125  1.0000000000000001e-28  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.246032  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4277  putative cytoplasmic protein  52.59 
 
 
147 aa  124  4.0000000000000003e-28  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0442  putative cytoplasmic protein  49.4 
 
 
102 aa  97.8  4e-20  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>