13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pden_4554 on replicon NC_008688
Organism: Paracoccus denitrificans PD1222



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008688  Pden_4554  hypothetical protein  100 
 
 		 165 aa  320  4e-87  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0505  hypothetical protein  43.14 
 
 		 173 aa  89.7  1e-17  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0691171  normal  0.116161 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0574  hypothetical protein  35.92 
 
 		 173 aa  86.7  1e-16  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.222814  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2227  hypothetical protein  35.21 
 
 		 173 aa  85.5  3e-16  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.619733 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0278  hypothetical protein  25.58 
 
 		 176 aa  79  0.00000000000003  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.0181031  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1438  hypothetical protein  28.25 
 
 		 175 aa  76.6  0.0000000000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2255  hypothetical protein  26.97 
 
 		 181 aa  75.1  0.0000000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0827383  normal  0.0532759 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1961  hypothetical protein  25.86 
 
 		 181 aa  72.4  0.000000000003  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  0.404493 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0870  hypothetical protein  31.55 
 
 		 171 aa  68.9  0.00000000003  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4100  hypothetical protein  28.14 
 
 		 168 aa  65.9  0.0000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3558  hypothetical protein  35.64 
 
 		 171 aa  62.4  0.000000003  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3668  hypothetical protein  28.89 
 
 		 172 aa  60.8  0.000000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.341575  normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0899  hypothetical protein  34.78 
 
 		 168 aa  57  0.0000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.513353  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>