58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Pcryo_0598 on replicon NC_007969
Organism: Psychrobacter cryohalolentis K5



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007969  Pcryo_0598  protein of unknown function DUF340, membrane  100 
 
 
303 aa  588  1e-167  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.189399  normal 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0630  hypothetical protein  95.38 
 
 
303 aa  543  1e-153  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1966  protein of unknown function DUF340, membrane  72.7 
 
 
326 aa  407  1.0000000000000001e-112  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0906  permease  41.08 
 
 
302 aa  210  3e-53  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0657608  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2768  protein of unknown function DUF340 membrane  39 
 
 
299 aa  194  2e-48  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2616  hypothetical protein  39.64 
 
 
298 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0947  hypothetical protein  39 
 
 
299 aa  194  2e-48  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1592  hypothetical protein  39.64 
 
 
298 aa  194  2e-48  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2700  protein of unknown function DUF340 membrane  39.64 
 
 
298 aa  194  2e-48  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2457  hypothetical protein  39 
 
 
299 aa  194  2e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.98715  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00885  hypothetical protein  39 
 
 
299 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00879  predicted transporter  39 
 
 
299 aa  194  2e-48  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2722  protein of unknown function DUF340 membrane  39 
 
 
299 aa  192  6e-48  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1035  hypothetical protein  39 
 
 
299 aa  192  6e-48  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0978  hypothetical protein  39 
 
 
299 aa  192  6e-48  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1056  hypothetical protein  37.84 
 
 
299 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0939  hypothetical protein  37.84 
 
 
299 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0903  hypothetical protein  38.67 
 
 
299 aa  191  1e-47  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.469991 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1005  hypothetical protein  37.84 
 
 
299 aa  191  1e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.85615  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0973  hypothetical protein  37.5 
 
 
299 aa  190  2e-47  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003756  membrane protein  35.57 
 
 
301 aa  190  2.9999999999999997e-47  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02630  hypothetical protein  36.24 
 
 
301 aa  189  4e-47  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1036  hypothetical protein  37.16 
 
 
299 aa  187  2e-46  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1974  protein of unknown function DUF340 membrane  37.63 
 
 
300 aa  185  9e-46  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1708  hypothetical protein  37.06 
 
 
300 aa  183  4.0000000000000006e-45  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.916772  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1667  protein of unknown function DUF340 membrane  41.01 
 
 
298 aa  182  7e-45  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.104731  normal  0.791329 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3666  protein of unknown function DUF340, membrane  41.14 
 
 
302 aa  179  4e-44  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0721  hypothetical protein  35.23 
 
 
301 aa  176  5e-43  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1391  protein of unknown function DUF340, membrane  36.9 
 
 
299 aa  171  1e-41  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0928  protein of unknown function DUF340, membrane  37.74 
 
 
308 aa  149  5e-35  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.726506  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0847  protein of unknown function DUF340 membrane  34.07 
 
 
304 aa  136  4e-31  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.83359  normal 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2034  membrane protein  35.37 
 
 
277 aa  121  1.9999999999999998e-26  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.259134  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2478  protein of unknown function DUF340 membrane  27.85 
 
 
312 aa  108  1e-22  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.75328  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1313  protein of unknown function DUF340 membrane  33.14 
 
 
190 aa  93.6  4e-18  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1190  protein of unknown function DUF340 membrane  35.71 
 
 
193 aa  90.5  3e-17  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000149231  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0324  protein of unknown function DUF340 membrane  33.15 
 
 
195 aa  84.3  0.000000000000002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.0202278  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0595  protein of unknown function DUF340, membrane  34.78 
 
 
195 aa  79.7  0.00000000000005  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.636868  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1660  protein of unknown function DUF340 membrane  34.64 
 
 
195 aa  76.3  0.0000000000007  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.429066  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3085  protein of unknown function DUF340 membrane  34.48 
 
 
197 aa  74.7  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.643763  normal  0.605218 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0241  protein of unknown function DUF340 membrane  33.7 
 
 
195 aa  74.7  0.000000000002  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0144  protein of unknown function DUF340 membrane  30.05 
 
 
199 aa  72.4  0.000000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0050  protein of unknown function DUF340 membrane  33.04 
 
 
200 aa  71.6  0.00000000001  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0355  protein of unknown function DUF340 membrane  29.07 
 
 
199 aa  71.6  0.00000000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07210  predicted membrane protein  25.7 
 
 
304 aa  71.2  0.00000000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.000000000277975  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1787  protein of unknown function DUF340 membrane  30.57 
 
 
314 aa  70.1  0.00000000004  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.238052  normal  0.778551 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1843  protein of unknown function DUF340 membrane  29.2 
 
 
289 aa  68.9  0.00000000009  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1394  protein of unknown function DUF340 membrane  25.87 
 
 
308 aa  66.2  0.0000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000734675  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2328  protein of unknown function DUF340, membrane  33.88 
 
 
200 aa  65.5  0.000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0859  protein of unknown function DUF340 membrane  35.19 
 
 
201 aa  62.4  0.000000008  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.502969 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2305  hypothetical protein  36.27 
 
 
200 aa  62.8  0.000000008  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.000000800916  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0718  protein of unknown function DUF340, membrane  30 
 
 
282 aa  61.6  0.00000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.877684 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21000  predicted membrane protein  28.81 
 
 
327 aa  60.5  0.00000003  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1823  protein of unknown function DUF340, membrane  35.65 
 
 
200 aa  58.5  0.0000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.564941 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1574  protein of unknown function DUF340, membrane  26.63 
 
 
279 aa  54.3  0.000003  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1134  protein of unknown function DUF340, membrane  28.8 
 
 
288 aa  52  0.00001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0812  protein of unknown function DUF340, membrane  25.41 
 
 
278 aa  49.3  0.00008  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_2905  protein of unknown function DUF340 membrane  23.66 
 
 
299 aa  49.3  0.00008  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_0612  protein of unknown function DUF340, membrane  24.47 
 
 
278 aa  45.8  0.001  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.454332  normal  0.780687 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>