58 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_4236 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008228  Patl_4236  GCN5-related N-acetyltransferase  100 
 
 		 205 aa  430  1e-120  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04003  GCN5-related N-acetyltransferase  32.79 
 
 		 195 aa  108  5e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0335  acetyltransferase  34.15 
 
 		 184 aa  57.8  0.0000001  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.793507  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0938  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40.68 
 
 		 176 aa  52  0.000007  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0184  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  25.34 
 
 		 146 aa  49.7  0.00003  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.648354  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0723  GCN5-related N-acetyltransferase  32.93 
 
 		 244 aa  49.3  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1527  GCN5-related N-acetyltransferase  39.66 
 
 		 152 aa  48.1  0.00008  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4510  GCN5-related N-acetyltransferase  32.88 
 
 		 204 aa  47.4  0.0001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0032578  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4914  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 98 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0583375  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0191  GCN5-related N-acetyltransferase  31.08 
 
 		 168 aa  47.4  0.0002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4966  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 98 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.013936  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4972  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 98 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.0284731  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4460  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  43.33 
 
 		 172 aa  46.6  0.0002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  hitchhiker  0.00479194  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4811  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 98 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.345894  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4879  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  40 
 
 		 98 aa  47.4  0.0002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00181448  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4968  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.00012833  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4607  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000000779076  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3684  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.895597  hitchhiker  0.000147746 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4920  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0578007  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4384  GCN5-related N-acetyltransferase  29.09 
 
 		 215 aa  46.6  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0795208  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2343  acetyltransferase  42.37 
 
 		 152 aa  46.6  0.0003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5885  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.276325  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_04214  hypothetical protein  38.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.31912  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_04248  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.258576  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3626  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.33 
 
 		 148 aa  46.2  0.0003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.0500841  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01970  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  35.59 
 
 		 151 aa  45.1  0.0008  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.638695  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2597  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.87 
 
 		 165 aa  45.1  0.0008  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.133462  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1197  GCN5-related N-acetyltransferase  21.2 
 
 		 198 aa  45.1  0.0008  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0563  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.98 
 
 		 149 aa  44.3  0.001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.647677 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0611  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  35.14 
 
 		 147 aa  44.3  0.001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4916  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 148 aa  44.3  0.001  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000006262  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3325  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.49 
 
 		 147 aa  43.9  0.002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4008  acetyltransferase  42.86 
 
 		 177 aa  43.9  0.002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0867  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38 
 
 		 144 aa  43.9  0.002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0991  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  36.67 
 
 		 150 aa  43.5  0.002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0274305  hitchhiker  0.00000000584057 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_5084  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  38.33 
 
 		 180 aa  43.5  0.002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3645  GCN5-related N-acetyltransferase  38.6 
 
 		 174 aa  43.5  0.002  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1874  GCN5-related N-acetyltransferase  33.9 
 
 		 197 aa  43.5  0.002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.723718  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1454  GCN5-related N-acetyltransferase  42.86 
 
 		 193 aa  43.1  0.003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.10684  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3447  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  36.49 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1332  GCN5-related N-acetyltransferase  36.23 
 
 		 159 aa  42.7  0.003  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_46440  putative acetyltransferase  42.86 
 
 		 177 aa  43.1  0.003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.000000264759  hitchhiker  0.000775438 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_24460  acetyltransferase  32.05 
 
 		 187 aa  43.1  0.003  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0828  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  33.78 
 
 		 147 aa  43.1  0.003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0141904  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002624  ribosomal-protein-S18p-alanine acetyltransferase  30.86 
 
 		 151 aa  42.7  0.004  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2992  SSU ribosomal protein S18P alanine acetyltransferase  36.96 
 
 		 156 aa  42.4  0.005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0208104  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2896  GCN5-related N-acetyltransferase  33.8 
 
 		 198 aa  42.4  0.005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3327  GCN5-related N-acetyltransferase  29.41 
 
 		 162 aa  42.4  0.005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.796902  normal  0.13657 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2212  GCN5-related N-acetyltransferase  43.4 
 
 		 165 aa  42.4  0.005  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0329  acetyltransferase  38.27 
 
 		 156 aa  42  0.006  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0532  ribosomal-protein-alanine N-acetyltransferase  38.33 
 
 		 147 aa  42  0.006  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.237603  normal  0.0207695 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0149  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  35.59 
 
 		 156 aa  42  0.006  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.182937  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0003  GCN5-related N-acetyltransferase  27.85 
 
 		 320 aa  42  0.006  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1155  ribosomal-protein-alanine acetyltransferase  27.16 
 
 		 145 aa  42  0.006  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1753  hypothetical protein  34.85 
 
 		 154 aa  42  0.007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.456587 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1515  acetyltransferase  32.14 
 
 		 184 aa  41.6  0.008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.42472  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2364  GCN5-related N-acetyltransferase  37.14 
 
 		 181 aa  41.2  0.01  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.74926  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2417  GCN5-related N-acetyltransferase  37.5 
 
 		 282 aa  41.2  0.01  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.0160018  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>