20 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Patl_1718 on replicon NC_008228
Organism: Pseudoalteromonas atlantica T6c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008228  Patl_1718  hypothetical protein  100 
 
 
108 aa  216  1e-55  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008765  Ajs_4190  hypothetical protein  47.44 
 
 
91 aa  82.4  0.000000000000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000445922 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1318  hypothetical protein  51.28 
 
 
95 aa  81.6  0.000000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.449673  normal  0.592375 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1622  hypothetical protein  39.36 
 
 
95 aa  68.9  0.00000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.256251  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1097  Domain of unknown function DUF1805  41.18 
 
 
97 aa  57.4  0.00000006  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  hitchhiker  0.0076621  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3059  hypothetical protein  40.48 
 
 
100 aa  53.1  0.000001  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2911  hypothetical protein  40.48 
 
 
100 aa  49.3  0.00002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0107  hypothetical protein  32.89 
 
 
99 aa  45.8  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0121  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.287558  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5119  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  44.3  0.0006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.354251  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0213  hypothetical protein  36.21 
 
 
108 aa  43.1  0.001  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5079  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5117  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0230578  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4799  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5112  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5208  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4701  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  43.5  0.001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4685  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4843  hypothetical protein  36.9 
 
 
100 aa  43.1  0.001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3571  hypothetical protein  32.5 
 
 
100 aa  41.6  0.004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>