11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_5656 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_5656  Cobalamin-3  100 
 
 		 215 bp  426  1e-117  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0302962  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3407  hypothetical protein  97.22 
 
 		 231 bp  63.9  0.00000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.338288 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25940  hypothetical protein  94.29 
 
 		 1095 bp  54  0.00002  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  decreased coverage  0.00053463  normal  0.0606013 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_R0060    91.89 
 
 		 205 bp  50.1  0.0002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_R0047    100 
 
 		 263 bp  50.1  0.0002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_R0034    100 
 
 		 267 bp  50.1  0.0002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_R0025    93.75 
 
 		 212 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.378241  normal  0.0216252 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_R0018    96.43 
 
 		 222 bp  48.1  0.001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.715719  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1187  outer membrane receptor for transport of vitamin B  100 
 
 		 2466 bp  46.1  0.004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.096047  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_R0012    100 
 
 		 221 bp  46.1  0.004  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3503  hypothetical protein  100 
 
 		 246 bp  46.1  0.004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.188544  normal  0.724266 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>