27 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPTO_0581 on replicon NC_004578
Organism: Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_004578  PSPTO_0581  DNA circulation protein, putative  100 
 
 		 607 aa  1233    Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.519076  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4591  DNA circulation, N-terminal  89.32 
 
 		 470 aa  441  9.999999999999999e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.422243  normal  1 
 
 
-
 
NC_007972  Rmet_6256  hypothetical protein  64.26 
 
 		 481 aa  416  9.999999999999999e-116  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1158  DNA circulation-like  54.55 
 
 		 411 aa  250  5e-65  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3864  phage FluMu DNA circulation protein, putative  43.84 
 
 		 420 aa  188  2e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.891467 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2135  hypothetical protein  31.66 
 
 		 1946 aa  139  1e-31  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.812003  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2588  DNA circulation family protein  46.53 
 
 		 438 aa  133  1.0000000000000001e-29  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  0.0328137 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4477  tail/DNA circulation protein  41.78 
 
 		 446 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00305287 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2252  tail/DNA circulation protein  41.78 
 
 		 446 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.257831 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2255  tail/DNA circulation protein  41.78 
 
 		 446 aa  117  6.9999999999999995e-25  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000334711 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3737  DNA circulation-like  41.22 
 
 		 415 aa  107  6e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2698  prophage MuSo2, DNA circulation protein, putative  37.69 
 
 		 438 aa  87  8e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3051  putative bacteriophage DNA circulation protein, Mu-like  30.41 
 
 		 475 aa  84.7  0.000000000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.273853  hitchhiker  0.000025391 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0745  DNA circulation protein  36.92 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0692  DNA circulation protein  36.92 
 
 		 439 aa  81.6  0.00000000000004  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3117  DNA circulation family protein  39 
 
 		 468 aa  76.3  0.000000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4486  Mu-like prophage DNA circulation protein-like protein  34.65 
 
 		 428 aa  74.7  0.000000000005  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.126188  normal  0.0913206 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1874  DNA circulation family protein  25.76 
 
 		 490 aa  74.3  0.000000000006  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000818097 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0189  DNA circulation family protein  30.63 
 
 		 439 aa  73.2  0.00000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1654  DNA circulation family protein  46.58 
 
 		 153 aa  73.6  0.00000000001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2737  putative DNA circulation protein  34.95 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1469  putative DNA circulation protein  34.95 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000007  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.539442 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2815  DNA circulation family protein  34.95 
 
 		 468 aa  70.9  0.00000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6587  putative Mu-like prophage DNA circulation protein  33.33 
 
 		 422 aa  67.8  0.0000000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0744  DNA circulation family protein  35.04 
 
 		 446 aa  67  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1950  hypothetical protein  25.6 
 
 		 488 aa  63.9  0.000000008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.212001  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2449  putative Mu-like prophage DNA circulation protein  27.92 
 
 		 159 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>