16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PSPA7_0375 on replicon NC_009656
Organism: Pseudomonas aeruginosa PA7



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009656  PSPA7_0375  hypothetical protein  100 
 
 
60 aa  120  5e-27  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981262  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03710  hypothetical protein  98.33 
 
 
60 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000191808 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0307  hypothetical protein  85 
 
 
60 aa  106  1e-22  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_5172  hypothetical protein  89.66 
 
 
60 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.147523  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0193  hypothetical protein  86.67 
 
 
60 aa  105  2e-22  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813264  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5079  hypothetical protein  89.66 
 
 
60 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215609  normal  0.98479 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5232  hypothetical protein  89.66 
 
 
60 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0290  hypothetical protein  87.93 
 
 
60 aa  104  5e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0085  hypothetical protein  87.5 
 
 
59 aa  102  2e-21  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4344  hypothetical protein  82.76 
 
 
60 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31710  hypothetical protein  88.68 
 
 
61 aa  97.4  6e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4651  hypothetical protein  44.44 
 
 
58 aa  47.8  0.00005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0621  hypothetical protein  45.1 
 
 
66 aa  47  0.00008  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000560407  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2850  Protein of unknown function DUF2292  46.15 
 
 
53 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1707  hypothetical protein  52.94 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.187485  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0734  hypothetical protein  44.19 
 
 
57 aa  41.2  0.005  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>