13 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Psyr_0085 on replicon NC_007005
Organism: Pseudomonas syringae pv. syringae B728a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007005  Psyr_0085  hypothetical protein  100 
 
 		 59 aa  119  9.999999999999999e-27  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0307  hypothetical protein  100 
 
 		 60 aa  113  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5232  hypothetical protein  89.66 
 
 		 60 aa  107  5e-23  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5172  hypothetical protein  89.66 
 
 		 60 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.147523  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5079  hypothetical protein  89.66 
 
 		 60 aa  107  6e-23  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.215609  normal  0.98479 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0193  hypothetical protein  89.66 
 
 		 60 aa  106  8.000000000000001e-23  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.813264  normal  0.927738 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0290  hypothetical protein  87.93 
 
 		 60 aa  105  2e-22  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_03710  hypothetical protein  89.29 
 
 		 60 aa  103  8e-22  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000191808 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0375  hypothetical protein  87.5 
 
 		 60 aa  102  2e-21  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981262  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4344  hypothetical protein  71.19 
 
 		 60 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_31710  hypothetical protein  83.02 
 
 		 61 aa  91.3  4e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0621  hypothetical protein  48 
 
 		 66 aa  48.5  0.00003  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000560407  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4651  hypothetical protein  44.74 
 
 		 58 aa  42.7  0.002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>