11 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_47890 on replicon NC_011683
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011683  PHATRDRAFT_47890  predicted protein  100 
 
 
402 aa  814    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3979  hypothetical protein  33.8 
 
 
172 aa  51.6  0.00002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2088  protein of unknown function DUF150  35.21 
 
 
154 aa  52  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2360  hypothetical protein  33.33 
 
 
155 aa  50.4  0.00006  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2078  hypothetical protein  37.5 
 
 
155 aa  49.7  0.00009  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.353581  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2713  hypothetical protein  31.08 
 
 
153 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3390  hypothetical protein  31.08 
 
 
153 aa  48.5  0.0002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  hitchhiker  0.00726554  normal  0.817312 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0595  hypothetical protein  37.5 
 
 
166 aa  48.1  0.0003  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0596  hypothetical protein  32.39 
 
 
153 aa  47.4  0.0005  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011689  PHATRDRAFT_39868  predicted protein  32.5 
 
 
248 aa  46.6  0.0008  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1871  hypothetical protein  32.39 
 
 
153 aa  45.4  0.002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.017158  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>