16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42892 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42892  predicted protein  100 
 
 
4067 aa  8386    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009362  OSTLU_42472  predicted protein  29.72 
 
 
3790 aa  295  1e-77  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009045  PICST_47351  Histone acetyltransferase SAGA, TRRAP/TRA1 component, PI-3 kinase superfamily TRA1  28.75 
 
 
2303 aa  279  1.0000000000000001e-72  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal  0.515914 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06110  histone acetyltransferase, putative  26.22 
 
 
3671 aa  253  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.607769  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_167  predicted protein  31.83 
 
 
1504 aa  155  2e-35  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.0272368  normal 
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_19336  predicted protein  22.79 
 
 
2197 aa  60.5  0.0000007  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.731599  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF03740  phosphatidylinositol 3-kinase TOR1  21.31 
 
 
2360 aa  59.7  0.000001  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.238017  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32127  cell cycle checkpoint protein  19.69 
 
 
2351 aa  59.7  0.000001  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00191937 
 
 
-
 
NC_009366  OSTLU_39103  predicted protein  20.28 
 
 
483 aa  58.9  0.000002  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.980682  normal  0.0247222 
 
 
-
 
BN001301  ANIA_05982  TorA protein [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q6KBA5]  18.24 
 
 
2385 aa  56.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.101038 
 
 
-
 
BN001304  ANIA_06975  UVSB [Source:UniProtKB/TrEMBL;Acc:Q9UV56]  19.46 
 
 
2454 aa  56.2  0.00001  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00482866 
 
 
-
 
NC_009046  PICST_33151  1-phosphatidylinositol 3-kinase.  21.73 
 
 
2483 aa  55.5  0.00002  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011681  PHATRDRAFT_21660  predicted protein  20.25 
 
 
2400 aa  54.3  0.00004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011680  PHATRDRAFT_51040  predicted protein  20.23 
 
 
607 aa  53.1  0.0001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006691  CNF02070  telomere length control protein, putative  19.63 
 
 
2967 aa  50.8  0.0006  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009044  PICST_59212  phosphatidylinositol kinase  20.69 
 
 
2904 aa  50.1  0.0008  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>