15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_42864 on replicon NC_011669
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011669  PHATRDRAFT_42864  predicted protein  100 
 
 
508 aa  1042    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.607616  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3598  HTTM domain protein  26.99 
 
 
521 aa  122  9.999999999999999e-27  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1644  HTTM  28.17 
 
 
602 aa  90.1  9e-17  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2331  HTTM domain protein  31.47 
 
 
523 aa  78.2  0.0000000000004  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.524598 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0078  HTTM domain protein  24.4 
 
 
613 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0076  HTTM domain protein  24.4 
 
 
613 aa  71.6  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.373411  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1979  hypothetical protein  32 
 
 
531 aa  71.6  0.00000000003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1602  HTTM domain protein  28.31 
 
 
505 aa  67.8  0.0000000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2906  HTTM domain protein  35.38 
 
 
497 aa  63.5  0.000000008  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147684  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2239  hypothetical protein  29.24 
 
 
529 aa  62.8  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610762  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2175  HTTM domain protein  30.34 
 
 
605 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2237  HTTM domain protein  30.34 
 
 
605 aa  60.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5635  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1197  hypothetical protein  32.53 
 
 
562 aa  60.8  0.00000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0621  HTTM domain protein  29.32 
 
 
538 aa  54.3  0.000005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1276  HTTM domain protein  24.7 
 
 
517 aa  52.8  0.00002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>