28 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ava_1644 on replicon NC_007413
Organism: Anabaena variabilis ATCC 29413



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007413  Ava_1644  HTTM  100 
 
 
602 aa  1234    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.709145 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0076  HTTM domain protein  55.48 
 
 
613 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.373411  normal  0.667135 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0078  HTTM domain protein  55.48 
 
 
613 aa  690    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2237  HTTM domain protein  43.78 
 
 
605 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.5635  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2175  HTTM domain protein  43.78 
 
 
605 aa  473  1e-132  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3598  HTTM domain protein  37.8 
 
 
521 aa  186  1.0000000000000001e-45  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2331  HTTM domain protein  36.75 
 
 
523 aa  150  8e-35  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.524598 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2239  hypothetical protein  30.42 
 
 
529 aa  149  1.0000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.610762  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1979  hypothetical protein  32.03 
 
 
531 aa  135  3e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2906  HTTM domain protein  37.41 
 
 
497 aa  133  1.0000000000000001e-29  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.147684  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0621  HTTM domain protein  36.04 
 
 
538 aa  129  1.0000000000000001e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0899  HTTM domain protein  36.01 
 
 
521 aa  128  3e-28  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1602  HTTM domain protein  35.54 
 
 
505 aa  127  7e-28  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1197  hypothetical protein  34.27 
 
 
562 aa  119  1.9999999999999998e-25  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1276  HTTM domain protein  33.77 
 
 
517 aa  107  5e-22  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_42864  predicted protein  28.17 
 
 
508 aa  89.7  1e-16  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.607616  n/a   
 
 
-
 
NC_011678  PHATRDRAFT_46618  predicted protein  26.97 
 
 
570 aa  79.7  0.0000000000001  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0564  HTTM domain-containing protein  25.6 
 
 
332 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.156372 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0552  hypothetical protein  25.6 
 
 
332 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0542  HTTM domain-containing protein  25.6 
 
 
332 aa  60.1  0.0000001  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.940548  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2136  hypothetical protein  23.08 
 
 
636 aa  58.9  0.0000003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.810683  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0068  HTTM domain protein  23.08 
 
 
319 aa  57  0.0000009  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1483  HTTM domain protein  17.89 
 
 
468 aa  56.2  0.000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_4974  HTTM domain protein  22.47 
 
 
362 aa  56.2  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0106846  normal  0.33114 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0340  hypothetical protein  22.84 
 
 
636 aa  55.8  0.000002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1172  vitamin K-dependent gamma-carboxylase  23.95 
 
 
415 aa  47.8  0.0006  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_31770  hypothetical protein  25.14 
 
 
289 aa  45.8  0.002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0154  HTTM domain protein  23.35 
 
 
533 aa  44.7  0.005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>