9 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_27234 on replicon NC_011675
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011675  PHATRDRAFT_27234  predicted protein  100 
 
 
363 aa  750    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009365  OSTLU_25255  predicted protein  48.99 
 
 
387 aa  313  3.9999999999999997e-84  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.448266  normal  0.989081 
 
 
-
 
NC_006692  CNG03510  RNA lariat debranching enzyme, putative  48.5 
 
 
606 aa  249  4e-65  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001307  ANIA_02457  RNA lariat debranching enzyme, putative (AFU_orthologue; AFUA_6G10370)  48.54 
 
 
692 aa  232  9e-60  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.771654  normal  0.230385 
 
 
-
 
NC_009044  PICST_45555  predicted protein  49.38 
 
 
476 aa  231  1e-59  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03937  CwfJ domain protein (AFU_orthologue; AFUA_6G08250)  28.12 
 
 
563 aa  48.1  0.0003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.0307545  normal 
 
 
-
 
NC_012030  Hlac_3455  metallophosphoesterase  27.71 
 
 
212 aa  47.8  0.0003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3014  metallophosphoesterase  25.69 
 
 
220 aa  47.4  0.0004  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0832  metallophosphoesterase  27.43 
 
 
216 aa  43.9  0.004  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.83627  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>