16 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC7424_5604 on replicon NC_011733
Organism: Cyanothece sp. PCC 7424



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011733  PCC7424_5604  hypothetical protein  100 
 
 
253 aa  525  1e-148  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011734  PCC7424_5622  Excinuclease ABC C subunit domain protein  92.86 
 
 
253 aa  493  9.999999999999999e-139  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013168  Cyan8802_4638  hypothetical protein  51.61 
 
 
251 aa  290  2e-77  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1664  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 
670 aa  48.1  0.0001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2623  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 
657 aa  45.4  0.0009  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.313972  normal  0.0935336 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1185  excinuclease ABC subunit C  40.38 
 
 
657 aa  45.4  0.0009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2244  excinuclease ABC subunit C  42.31 
 
 
671 aa  45.1  0.001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208869  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1627  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 
649 aa  44.3  0.002  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1783  excinuclease ABC subunit C  38.6 
 
 
653 aa  43.5  0.003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3743  Excinuclease ABC C subunit domain protein  33.77 
 
 
348 aa  43.5  0.004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0699  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
690 aa  43.1  0.005  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_04670  excinuclease ABC, C subunit  30.34 
 
 
598 aa  43.1  0.005  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3451  DNA polymerase III, epsilon subunit  29.11 
 
 
453 aa  42.7  0.006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0690  excinuclease ABC subunit C  33.33 
 
 
690 aa  42.4  0.006  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.485523  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1932  excinuclease ABC subunit C  37.93 
 
 
692 aa  42.4  0.007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0596454 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3071  excinuclease ABC subunit C  34.48 
 
 
666 aa  42  0.01  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal  0.104029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>