14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_1351 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_1351  hypothetical protein  100 
 
 		 268 aa  555  1e-157  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3930  hypothetical protein  55.51 
 
 		 263 aa  263  2e-69  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04900  hypothetical protein  55.38 
 
 		 253 aa  211  1e-53  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.475005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3984  hypothetical protein  43.87 
 
 		 253 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0389  hypothetical protein  42.11 
 
 		 247 aa  187  2e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3985  hypothetical protein  46.19 
 
 		 253 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3986  hypothetical protein  48.39 
 
 		 254 aa  177  2e-43  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0594  hypothetical protein  54.86 
 
 		 267 aa  171  9e-42  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.464549  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4029  hypothetical protein  45.16 
 
 		 272 aa  170  2e-41  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0243  hypothetical protein  48.41 
 
 		 273 aa  159  4e-38  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0163  hypothetical protein  40.96 
 
 		 235 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00127626  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0891  hypothetical protein  47.17 
 
 		 264 aa  137  3.0000000000000003e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0410  hypothetical protein  48.23 
 
 		 196 aa  136  4e-31  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3766  hypothetical protein  32.09 
 
 		 243 aa  46.6  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.17281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>