14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd703_4029 on replicon NC_012880
Organism: Dickeya dadantii Ech703



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012880  Dd703_4029  hypothetical protein  100 
 
 
272 aa  546  1e-154  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_04900  hypothetical protein  52.4 
 
 
253 aa  201  7e-51  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.475005  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3984  hypothetical protein  50 
 
 
253 aa  198  7e-50  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3985  hypothetical protein  56.48 
 
 
253 aa  190  2e-47  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0389  hypothetical protein  45.79 
 
 
247 aa  187  1e-46  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3986  hypothetical protein  46.59 
 
 
254 aa  186  4e-46  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0891  hypothetical protein  48.5 
 
 
264 aa  181  1e-44  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.643944 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0594  hypothetical protein  44.74 
 
 
267 aa  176  4e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.464549  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1351  hypothetical protein  45.16 
 
 
268 aa  170  2e-41  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3930  hypothetical protein  44.59 
 
 
263 aa  157  1e-37  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0163  hypothetical protein  43.16 
 
 
235 aa  149  4e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00127626  normal  0.968152 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0243  hypothetical protein  42.61 
 
 
273 aa  144  2e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0410  hypothetical protein  39.33 
 
 
196 aa  114  1.0000000000000001e-24  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.500594  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3766  hypothetical protein  29.2 
 
 
243 aa  48.9  0.00009  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.17281 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>