76 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0402 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012917  PC1_0402  Glutathione transferase  100 
 
 
139 aa  293  4e-79  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4824  metallothiol transferase FosB  60.29 
 
 
140 aa  180  5.0000000000000004e-45  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4899  metallothiol transferase FosB  59.56 
 
 
140 aa  175  2e-43  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1321  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  61.76 
 
 
138 aa  171  1.9999999999999998e-42  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49780  fosfomycin resistance protein  61.03 
 
 
135 aa  162  2.0000000000000002e-39  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2503  Glutathione transferase  57.78 
 
 
135 aa  159  9e-39  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2409  Glutathione transferase  55.88 
 
 
137 aa  158  2e-38  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.121998  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02481  hypothetical protein  51.09 
 
 
155 aa  147  5e-35  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3136  glutathione transferase  55.08 
 
 
113 aa  134  6.0000000000000005e-31  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0588  hypothetical protein  43.85 
 
 
136 aa  122  2e-27  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1441  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  43.94 
 
 
150 aa  117  7e-26  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2074  fosfomycin resistance protein FosB  36.09 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2042  fosfomycin resistance protein FosB  36.09 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1895  fosfomycin resistance protein FosB  36.09 
 
 
138 aa  90.9  5e-18  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1847  fosfomycin resistance protein FosB  36.09 
 
 
138 aa  90.1  9e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2143  fosfomycin resistance protein FosB  36.64 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2111  fosfomycin resistance protein FosB  36.09 
 
 
138 aa  89.7  1e-17  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.602567  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1892  fosfomycin resistance protein FosB  36.84 
 
 
138 aa  88.6  3e-17  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.05854  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1857  fosfomycin resistance protein FosB  34.59 
 
 
138 aa  87.8  5e-17  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.775676  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3277  fosfomycin resistance protein FosB  35.38 
 
 
138 aa  85.9  2e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2032  fosfomycin resistance protein FosB  34.62 
 
 
138 aa  85.1  3e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4109  fosfomycin resistance protein FosB  33.82 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3818  fosfomycin resistance protein FosB  33.82 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1533  fosfomycin resistance protein FosB  35.16 
 
 
139 aa  82  0.000000000000002  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP2349  fosfomycin resistance protein FosB  33.33 
 
 
142 aa  77.8  0.00000000000004  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3695  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.59 
 
 
136 aa  75.5  0.0000000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.000000000231373  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2401  fosfomycin resistance protein FosB  35.94 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2358  fosfomycin resistance protein FosB  35.94 
 
 
139 aa  74.3  0.0000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0572  hypothetical protein  30.08 
 
 
146 aa  50.4  0.000007  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.985503  normal  0.0152096 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2767  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
154 aa  49.7  0.00001  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00325251  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2367  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  32.79 
 
 
135 aa  49.3  0.00002  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.015885 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0332  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.82 
 
 
191 aa  48.5  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3986  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.294887  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3927  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.494573  normal  0.163495 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3912  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.67 
 
 
133 aa  48.1  0.00004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.789032  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0457  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.78 
 
 
162 aa  47.8  0.00005  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0408  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.33 
 
 
191 aa  47.4  0.00007  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.322497  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2195  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.42 
 
 
130 aa  46.6  0.0001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.811141  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1454  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  29.91 
 
 
166 aa  45.8  0.0002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.137166  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0375  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25.86 
 
 
164 aa  45.4  0.0002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.158959 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2054  fosfomycin resistance protein FosB  36.51 
 
 
74 aa  45.4  0.0002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.415185  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2229  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  38.78 
 
 
172 aa  45.4  0.0003  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2089  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.27 
 
 
148 aa  45.4  0.0003  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0952  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.9 
 
 
132 aa  45.1  0.0004  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.933623  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1155  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.66 
 
 
124 aa  44.7  0.0005  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0578  fosfomycin resistance family protein  28.68 
 
 
132 aa  43.1  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0995  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.79 
 
 
150 aa  43.1  0.001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.453501  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1699  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.4 
 
 
129 aa  43.5  0.001  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.268635  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2795  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.03 
 
 
134 aa  43.5  0.001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.111231  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2268  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.41 
 
 
138 aa  43.1  0.001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  0.337413  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10278  hypothetical protein  26 
 
 
207 aa  43.1  0.001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.00492026  normal  0.278062 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2213  hypothetical protein  27.56 
 
 
162 aa  43.1  0.001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.666826 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3872  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.67 
 
 
121 aa  42.7  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.765477 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2432  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.23 
 
 
264 aa  42.7  0.002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4897  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.17 
 
 
130 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.523633  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4359  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  29.75 
 
 
128 aa  42.7  0.002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.516097  hitchhiker  0.00717168 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0377  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.26 
 
 
165 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0524594  n/a   
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0992  hypothetical protein  33.59 
 
 
185 aa  42.7  0.002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1194  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.931119  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2775  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.95 
 
 
227 aa  42  0.003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0715  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  33.33 
 
 
127 aa  41.6  0.003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.981181  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1002  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  26.02 
 
 
255 aa  41.6  0.003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1488  methylmalonyl-CoA epimerase  29.76 
 
 
134 aa  41.6  0.004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.383789  normal  0.131397 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1771  glutathione S-transferase, fosfomycin resistance protein, putative  25 
 
 
158 aa  41.2  0.004  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.154627 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5687  catechol 2,3-dioxygenase  28.57 
 
 
314 aa  41.2  0.005  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.581242  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1254  lactoylglutathione lyase or related lyase  28.03 
 
 
131 aa  41.2  0.005  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.351089  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1183  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  23.49 
 
 
265 aa  41.2  0.005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0410  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  25 
 
 
164 aa  40.8  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.909465 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0614  Glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  31.82 
 
 
304 aa  40.8  0.006  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0496  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  41.38 
 
 
130 aa  40.4  0.008  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_20240  putative ring-cleaving dioxygenase  32.31 
 
 
137 aa  40.4  0.008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.504368  normal  0.859939 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3747  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  24.39 
 
 
304 aa  40.4  0.008  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1740  putative ring-cleaving dioxygenase  32.31 
 
 
137 aa  40.4  0.009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_2568  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
139 aa  40  0.009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.476855  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3147  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  28.57 
 
 
139 aa  40  0.009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2482  glyoxalase/bleomycin resistance protein/dioxygenase  27.13 
 
 
184 aa  40.4  0.009  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.204779  normal  0.0473922 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>