15 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1601 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1600  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.185458 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1601  excinuclease ABC subunit C  100 
 
 		 84 aa  174  5e-43  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.188108 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1602  excinuclease ABC subunit C  97.62 
 
 		 84 aa  170  5.999999999999999e-42  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.316272 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1266  excinuclease ABC subunit C  33.75 
 
 		 109 aa  44.7  0.0004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0720825  normal  0.107878 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2985  Excinuclease ABC C subunit domain protein  34.78 
 
 		 80 aa  43.5  0.001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00056528  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0706  excinuclease ABC subunit C  37.84 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.200173  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1984  Excinuclease ABC C subunit domain protein  30.43 
 
 		 100 aa  42.4  0.002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.569269  normal  0.376959 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2599  excinuclease ABC subunit C  37.88 
 
 		 100 aa  41.6  0.003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.515816  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4762  excinuclease ABC subunit C  30.88 
 
 		 95 aa  42  0.003  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000128421 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4673  excinuclease ABC subunit C  37.33 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0203068  normal  0.740164 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3578  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.45 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1362  excinuclease ABC subunit C  33.77 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.679973  normal  1 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4013  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.45 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3712  GIY-YIG nuclease superfamily protein  45.45 
 
 		 95 aa  40.8  0.006  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0003  excinuclease ABC subunit C  32.94 
 
 		 95 aa  40.4  0.009  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.164369  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>