14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_3122 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007406  Nwi_3122  hypothetical protein  100 
 
 
284 aa  589  1e-167  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2345  hypothetical protein  92.91 
 
 
282 aa  549  1e-155  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.129734  normal  0.0203272 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0971  hypothetical protein  56.52 
 
 
277 aa  333  2e-90  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2546  hypothetical protein  55.07 
 
 
277 aa  330  2e-89  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1402  hypothetical protein  37.76 
 
 
307 aa  202  5e-51  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.201679  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0680  hypothetical protein  31.88 
 
 
294 aa  167  2e-40  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2465  hypothetical protein  32.73 
 
 
279 aa  143  3e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000153647  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1895  hypothetical protein  30.82 
 
 
317 aa  132  6.999999999999999e-30  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0457174  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2218  hypothetical protein  30.47 
 
 
317 aa  132  9e-30  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.545935 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3499  hypothetical protein  27.49 
 
 
342 aa  119  3.9999999999999996e-26  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0371842  normal  0.59923 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2120  hypothetical protein  27.97 
 
 
309 aa  117  1.9999999999999998e-25  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.530906  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc2066  hypothetical protein  27.5 
 
 
316 aa  101  1e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.615053  normal 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0007  hypothetical protein  27.3 
 
 
285 aa  101  1e-20  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0983  hypothetical protein  26.04 
 
 
315 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>