14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_3963 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_3963    100 
 
 		 866 bp  1717    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.244453  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3994  transposase and inactivated derivatives-like  99.21 
 
 		 504 bp  967    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3997    98.83 
 
 		 363 bp  644    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4391    96.42 
 
 		 330 bp  521  1.0000000000000001e-145  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1202    92.17 
 
 		 243 bp  295  1e-77  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.530452  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3993  hypothetical protein  90.43 
 
 		 609 bp  141  4e-31  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4093  transposase, IS4  88.71 
 
 		 765 bp  67.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007959  Nham_4264  transposase, IS4  88.71 
 
 		 756 bp  67.9  0.000000005  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.861429  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3964  peptidase M15B and M15C, D,D-carboxypeptidase VanY/endolysins  100 
 
 		 1254 bp  50.1  0.001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.65119  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5236    96.55 
 
 		 132 bp  50.1  0.001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0623208  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1516  transposase  83.33 
 
 		 468 bp  48.1  0.004  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  hitchhiker  0.000901258  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1210    93.75 
 
 		 486 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3813  hypothetical protein  93.75 
 
 		 441 bp  48.1  0.004  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.281862  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0393  transposase (class IV)  91.67 
 
 		 216 bp  48.1  0.004  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.216875  normal  0.703561 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>