14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nham_1920 on replicon NC_007964
Organism: Nitrobacter hamburgensis X14



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007964  Nham_1920  hypothetical protein  100 
 
 		 133 aa  275  1e-73  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1352  hypothetical protein  69.53 
 
 		 159 aa  194  4.0000000000000005e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4718  hypothetical protein  70.31 
 
 		 136 aa  193  7e-49  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1372  hypothetical protein  67.97 
 
 		 136 aa  190  5e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4044  hypothetical protein  65.89 
 
 		 157 aa  176  1e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89225  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4031  hypothetical protein  56.8 
 
 		 153 aa  146  9e-35  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  0.020129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2230  hypothetical protein  48.44 
 
 		 129 aa  126  1.0000000000000001e-28  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2607  hypothetical protein  43.65 
 
 		 160 aa  95.9  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114911  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0425  hypothetical protein  48.36 
 
 		 131 aa  94  6e-19  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0419  hypothetical protein  44.62 
 
 		 158 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3595  hypothetical protein  42.98 
 
 		 130 aa  89  2e-17  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521836  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0797  hypothetical protein  40.34 
 
 		 124 aa  78.2  0.00000000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0743  hypothetical protein  34.43 
 
 		 123 aa  69.7  0.00000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2896  hypothetical protein  35.25 
 
 		 123 aa  59.7  0.00000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039157  decreased coverage  0.00427012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>