14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene RPB_1372 on replicon NC_007778
Organism: Rhodopseudomonas palustris HaA2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007778  RPB_1372  hypothetical protein  100 
 
 		 136 aa  285  2e-76  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.53119  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1352  hypothetical protein  92.65 
 
 		 159 aa  271  2.0000000000000002e-72  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4718  hypothetical protein  86.76 
 
 		 136 aa  253  6e-67  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.281575  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4044  hypothetical protein  72.26 
 
 		 157 aa  206  7e-53  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.89225  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1920  hypothetical protein  67.97 
 
 		 133 aa  190  5e-48  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4031  hypothetical protein  59.5 
 
 		 153 aa  157  6e-38  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.179173  normal  0.020129 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2230  hypothetical protein  44.96 
 
 		 129 aa  120  6e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2607  hypothetical protein  42.06 
 
 		 160 aa  99  2e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.114911  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3595  hypothetical protein  46.49 
 
 		 130 aa  99.4  2e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.521836  normal  0.0274344 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0425  hypothetical protein  43.8 
 
 		 131 aa  97.8  4e-20  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.687752  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0419  hypothetical protein  43.17 
 
 		 158 aa  95.5  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.462132  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0797  hypothetical protein  40.52 
 
 		 124 aa  81.6  0.000000000000003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739543 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0743  hypothetical protein  37.29 
 
 		 123 aa  76.6  0.0000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.633559 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2896  hypothetical protein  33.9 
 
 		 123 aa  55.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.039157  decreased coverage  0.00427012 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>