18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1883 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_014210  Ndas_1883  hypothetical protein  100 
 
 		 214 aa  407  1e-113  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.381407  normal  0.510269 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4129  hypothetical protein  60.29 
 
 		 233 aa  231  7.000000000000001e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1014  hypothetical protein  44.61 
 
 		 218 aa  150  2e-35  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0531  hypothetical protein  50.35 
 
 		 217 aa  134  9.999999999999999e-31  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.489053 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5263  hypothetical protein  43.65 
 
 		 231 aa  132  3e-30  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3695  hypothetical protein  44.05 
 
 		 228 aa  118  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.102774 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5653  hypothetical protein  47.52 
 
 		 225 aa  117  9.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.44795  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0867  hypothetical protein  42.37 
 
 		 222 aa  111  8.000000000000001e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.520072  normal  0.146008 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2389  hypothetical protein  39 
 
 		 211 aa  106  3e-22  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.460334  normal  0.447336 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5291  hypothetical protein  41.04 
 
 		 230 aa  105  6e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6106  hypothetical protein  41.72 
 
 		 232 aa  103  2e-21  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2694  hypothetical protein  37.78 
 
 		 253 aa  100  1e-20  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.498178  normal  0.47344 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2638  hypothetical protein  43.15 
 
 		 231 aa  87.8  1e-16  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.0006014  normal  1 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2204  hypothetical protein  38.89 
 
 		 222 aa  84.7  9e-16  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2310  hypothetical protein  40 
 
 		 254 aa  83.6  0.000000000000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.420638  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0199  hypothetical protein  38.97 
 
 		 206 aa  62.4  0.000000005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.714178 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1102  hypothetical protein  29.52 
 
 		 258 aa  57.4  0.0000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.578838  normal  0.478034 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3664  hypothetical protein  34.48 
 
 		 228 aa  56.6  0.0000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.10428  normal  0.446029 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>