18 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2276 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011666  Msil_2276  hypothetical protein  100 
 
 
126 aa  259  1e-68  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6437  hypothetical protein  91.06 
 
 
126 aa  232  1.0000000000000001e-60  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2092  hypothetical protein  58.06 
 
 
127 aa  152  2e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496142  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1701  hypothetical protein  53.23 
 
 
127 aa  140  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5164  hypothetical protein  54.17 
 
 
134 aa  135  2e-31  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0439  hypothetical protein  36.97 
 
 
126 aa  73.6  0.0000000000008  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05337  hypothetical protein  28.32 
 
 
125 aa  60.8  0.000000006  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0845  hypothetical protein  36.45 
 
 
113 aa  57.8  0.00000006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.205653 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1744  hypothetical protein  29.46 
 
 
155 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.991206  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2759  hypothetical protein  33.33 
 
 
132 aa  53.9  0.0000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1583  hypothetical protein  24.37 
 
 
127 aa  52  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2252  hypothetical protein  25.89 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0089  hypothetical protein  25.89 
 
 
132 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.567246  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1151  hypothetical protein  25.89 
 
 
130 aa  48.9  0.00002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1527  hypothetical protein  25.89 
 
 
132 aa  48.5  0.00003  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0924  hypothetical protein  25.89 
 
 
199 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1009  hypothetical protein  26.79 
 
 
199 aa  48.5  0.00003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4084  hypothetical protein  25.62 
 
 
123 aa  42.7  0.002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.352089  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>