21 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene BURPS1106A_A0924 on replicon NC_009078
Organism: Burkholderia pseudomallei 1106a



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009078  BURPS1106A_A0924  hypothetical protein  100 
 
 
199 aa  404  1.0000000000000001e-112  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.391648  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1009  hypothetical protein  97.99 
 
 
199 aa  398  9.999999999999999e-111  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.235357  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_0089  hypothetical protein  99.24 
 
 
132 aa  274  7e-73  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.567246  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A2252  hypothetical protein  97.73 
 
 
132 aa  271  6e-72  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A1527  hypothetical protein  98.48 
 
 
132 aa  270  7e-72  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.571164  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1151  hypothetical protein  99.23 
 
 
130 aa  268  2.9999999999999997e-71  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1744  hypothetical protein  75.64 
 
 
155 aa  244  6e-64  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.991206  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1583  hypothetical protein  58.06 
 
 
127 aa  152  2e-36  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05337  hypothetical protein  48.76 
 
 
125 aa  119  3e-26  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0845  hypothetical protein  50.91 
 
 
113 aa  114  7.999999999999999e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.205653 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4084  hypothetical protein  34.35 
 
 
123 aa  72  0.000000000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.352089  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7128  hypothetical protein  40.74 
 
 
135 aa  67.4  0.0000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2759  hypothetical protein  34.95 
 
 
132 aa  66.2  0.0000000003  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2092  hypothetical protein  28.07 
 
 
127 aa  57  0.0000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.496142  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4627  hypothetical protein  35.25 
 
 
125 aa  56.2  0.0000003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.377564  normal  0.0143753 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1701  hypothetical protein  27.19 
 
 
127 aa  54.7  0.0000008  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6437  hypothetical protein  27.19 
 
 
126 aa  51.2  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2276  hypothetical protein  25.89 
 
 
126 aa  48.5  0.00007  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5164  hypothetical protein  28.12 
 
 
134 aa  47.8  0.0001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.81084  normal  0.0125945 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0439  hypothetical protein  25.64 
 
 
126 aa  42.7  0.003  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002967  TDE1368  hypothetical protein  23.76 
 
 
122 aa  42.7  0.004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>