14 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpe_A1181 on replicon NC_008825
Organism: Methylibium petroleiphilum PM1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008758  Pnap_4584  putative ATP-binding protein  48 
 
 		 1111 aa  946    Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A1181  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 1110 aa  2242    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.562353  normal  0.115598 
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0172  putative ATP-binding protein  100 
 
 		 1110 aa  2242    Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000291246 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2113  putative ATP-binding protein  46.68 
 
 		 884 aa  780    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.555266  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2090  hypothetical protein  29.26 
 
 		 1138 aa  462  9.999999999999999e-129  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.00173694  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00121  putative ATP-binding protein  30.34 
 
 		 1077 aa  421  1e-116  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.814389  n/a   
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0311  hypothetical protein  27.11 
 
 		 1168 aa  363  1e-98  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0120008  n/a   
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5328  hypothetical protein  27.83 
 
 		 1155 aa  292  2e-77  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.151997 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0591  hypothetical protein  26.1 
 
 		 1192 aa  240  1e-61  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8685  hypothetical protein  25.98 
 
 		 1205 aa  226  2e-57  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3012  hypothetical protein  22.97 
 
 		 1071 aa  216  1.9999999999999998e-54  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.810934  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0641  hypothetical protein  26.9 
 
 		 976 aa  180  2e-43  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1752  hypothetical protein  30.94 
 
 		 1123 aa  53.9  0.00002  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0791  hypothetical protein  28.57 
 
 		 1389 aa  45.1  0.008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>