12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1370 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011832  Mpal_1370  DNA sulfur modification protein DndE  100 
 
 
138 aa  289  1e-77  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0297592  normal  0.728209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0357  hypothetical protein  80.74 
 
 
141 aa  240  3.9999999999999997e-63  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4570  hypothetical protein  36.22 
 
 
125 aa  79  0.00000000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198668  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0831  hypothetical protein  38.39 
 
 
126 aa  71.2  0.000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0173  DNA sulfur modification protein DndE  33.61 
 
 
125 aa  60.1  0.000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4844  DNA sulfur modification protein DndE  35.38 
 
 
132 aa  59.3  0.00000002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.936461 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3762  hypothetical protein  35.92 
 
 
128 aa  55.8  0.0000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2211  hypothetical protein  33.05 
 
 
133 aa  51.2  0.000005  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2476  hypothetical protein  31.07 
 
 
132 aa  47.8  0.00005  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161397  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2399  DNA sulfur modification protein DndE  38.61 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2456  DNA sulfur modification protein DndE  38.61 
 
 
130 aa  45.1  0.0004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0473019 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0009  DNA sulfur modification protein DndE  31.68 
 
 
128 aa  41.2  0.005  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>