12 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cyan8802_2456 on replicon NC_013161
Organism: Cyanothece sp. PCC 8802



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011726  PCC8801_2399  DNA sulfur modification protein DndE  100 
 
 
130 aa  273  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2456  DNA sulfur modification protein DndE  100 
 
 
130 aa  273  6e-73  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0473019 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4844  DNA sulfur modification protein DndE  82.79 
 
 
132 aa  218  3e-56  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.936461 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2211  hypothetical protein  73.44 
 
 
133 aa  206  1e-52  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3762  hypothetical protein  73.6 
 
 
128 aa  200  6e-51  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0617716 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0173  DNA sulfur modification protein DndE  50.83 
 
 
125 aa  125  2.0000000000000002e-28  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2476  hypothetical protein  34.09 
 
 
132 aa  87  8e-17  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0161397  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0009  DNA sulfur modification protein DndE  37.5 
 
 
128 aa  76.3  0.0000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0741  hypothetical protein  31.19 
 
 
119 aa  65.1  0.0000000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0326582  normal  0.737644 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1370  DNA sulfur modification protein DndE  37.86 
 
 
138 aa  58.9  0.00000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0297592  normal  0.728209 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0357  hypothetical protein  39.81 
 
 
141 aa  57.4  0.00000007  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.178262 
 
 
-
 
NC_008244  Meso_4570  hypothetical protein  30.56 
 
 
125 aa  41.2  0.005  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.198668  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>