23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mpal_1084 on replicon NC_011832
Organism: Methanosphaerula palustris E1-9c



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011832  Mpal_1084  hypothetical protein  100 
 
 		 112 aa  229  1e-59  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  decreased coverage  0.000536212  normal  0.432812 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0858  hypothetical protein  80.36 
 
 		 112 aa  190  6e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.270676  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1659  hypothetical protein  72.32 
 
 		 112 aa  177  5.999999999999999e-44  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.541388  normal  0.0564828 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0078  hypothetical protein  63.39 
 
 		 112 aa  158  2e-38  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.153667  normal  0.432637 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0968  hypothetical protein  61.95 
 
 		 114 aa  147  5e-35  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.00181783  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2902  hypothetical protein  58.93 
 
 		 129 aa  145  2.0000000000000003e-34  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.898547  hitchhiker  0.000859675 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0931  hypothetical protein  59.09 
 
 		 119 aa  140  8e-33  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  0.863656  normal  0.159224 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0925  hypothetical protein  56.64 
 
 		 114 aa  133  8e-31  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3353  Protein of unknown function DUF555  55.36 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.495659  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1566  Protein of unknown function DUF555  54.46 
 
 		 117 aa  132  1.9999999999999998e-30  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2742  Protein of unknown function DUF555  55.86 
 
 		 123 aa  130  7.999999999999999e-30  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0869  hypothetical protein  55.36 
 
 		 124 aa  130  9e-30  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2774  hypothetical protein  58.1 
 
 		 124 aa  129  9e-30  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.489776  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0753  hypothetical protein  52.21 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.0232818  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1165  hypothetical protein  52.21 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.068584  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0819  hypothetical protein  52.21 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0068  hypothetical protein  52.21 
 
 		 113 aa  122  1e-27  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0273  hypothetical protein  47.79 
 
 		 113 aa  120  5e-27  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  decreased coverage  0.000000138863  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2408  Protein of unknown function DUF555  45.19 
 
 		 161 aa  94.4  5e-19  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.696008  normal  0.514494 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1516  hypothetical protein  47.32 
 
 		 152 aa  93.2  1e-18  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.0166402 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0822  hypothetical protein  44.44 
 
 		 169 aa  90.1  9e-18  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0524  Protein of unknown function DUF555  45.71 
 
 		 195 aa  88.2  4e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2443  Protein of unknown function DUF555  45.54 
 
 		 151 aa  82.8  0.000000000000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>